รอยพระพุทธบาทคู่ เป็นรอยพระพุทธบาทที่ใหญ่และเก่าแก่ที่สุดในประเทศไทย สลักบนบนศิลาแลง คาดว่าสร้างขึ้นครั้งแรกสมัยทวารวดีถึงสมัยลพบุรี  ที่ฝ่าพระบาทสลักรูปธรรมจักรนูนทั้งสองข้าง และยังมีการสลักรูปกากบาท ที่ตรงกลางมีหลุมสำหรับใช้ปักเสา สันนิษฐานว่ามีไว้เพื่อปักฉัตรหรือร่ม ใกล้กันมีบ่อน้ำศักดิ์สิทธิ์ซึ่งพบพระพุทธรูปและโบราณวัตถุเป็นจำนวนมาก

จัดแสดงนิทรรศการความรู้เกี่ยวกับโบราณสถานที่อยู่ใบริวเณนี้ได้แก่เมืองศรีมโหสถและโบราณสถานศรีมโหสถ  ภายในจัดแสดงโบราณวัตถุที่ค้นพบในบริเวณนั้น ที่สำคัญ ๆ เช่น
จารึกเนินสระบัว (ศิลาจารึกหลักที่ 56)เป็นศิลาจารึกหินทรายสีขาวขนาดกว้าง 40 ซม. ยาว 177 ซม.

สระมรกต เป็นบึงน้ำโบราณรูปสี่เหลี่ยมผืนผ้า กว้างประมาณ 115 เมตร ยาว 214 เมตร ลึก 3.50 เมตร  พื้นที่ประมาณ 25 ไร่ ตั้งอยู่กลางธรรมชาติล้อมรอบ มีบัวบานอยู่กลางสระ สันนิษฐานว่าขุดขึ้นมาเพื่อใช้เป็นแหล่งน้ำและนำศิลาแลงไปใช้เป็นสถาปัตยกรรม ใกล้กันมีแบบจำลองเมืองโบราณให้ได้ชม

เทศกาลมาฆปูรมีศรีปราจีน เป็นงานทางพุทธศาสนาที่สำคัญของจังหวัดปราจีนบุรี จัดขึ้นที่วัดสระมรกต ในวันวันมาฆบูชา หรือ วันจาตุรงคสันนิบาต ตรงกับวันขึ้น 15 ค่ำ เดือน 3 ของทุกปี เพื่อสืบสานเรื่องราวในพุทธกาล พุทธศาสนิกชนจะนุ่งขาวห่มขาวร่วมปฏิบัติธรรมและฝึกสมาธิ  ตักบาตรและถวายภัตตาหารเพลกับพระภิกษุสงฆ์ระหว่างเดินธุดงค์ มีขบวนแห่โคมประทีป ฟังเทศน์โอวาทปาฏิโมกข์ โดยภายในบริเวณโบราณสถานวัดสระมรกตจะมีการจุดเทียนบูชา มีความงดงามเป็นอย่างมาก